中國船長被捕后搭乘“水城”號巡視船于8號上午7點25分到達日本沖繩?石垣港口，隨后被石垣海上保安部的車子帶走接受調查。中國漁船上另外14名船員則是同搭乘的中國漁船一起，在日本保安部水警的監視下向沖繩-石垣港進發，預計將于傍晚左右到達港口。據悉，日本該保安部相關人員表示將會對中國漁船的情況進行勘察，并且會依據調查需要對船上人員進行問訊。

　　日本保安廳稱此次逮捕中國船長的理由是，其涉嫌于9月7日上午10點56分左右，在尖閣諸島（中國稱“釣魚群島”）的久場島（中國稱為“黃尾嶼”）西北約15公里處日本領海海域內不接受對其進行追蹤的“水城”號巡視船的停船命令，并突然轉舵，導致“水城”號與中國漁船發生碰撞。而這一行為已經妨礙了日本保安廳海上保安官執行公務。

　　另外據日本方面稱，在中國漁船與“水城”號巡視船發生碰撞之前的40分鐘左右，在釣魚島西北約12公里處的日本領海已經與一艘名為“與那國”的巡視船發生了碰撞。當時，“與那國”號發現中國漁船存在違法從事海上捕魚作業的嫌疑，正欲靠近以催促其離開。